BASICからグラフィックを描かせる場合、グラフィックマクロコマンドを使うのですが、そのコマンド文字列をそのままZ8001に送り、Z8001が構文解析してDDAに演算・描画させるという流れのようです。メインCPUの6502(YM-2002)がユーザインタフェース、Z8001がメインCPU、DDAが今でいうGPU、といった関係ですね。
ちなみにZ8001のマクロ構文処理は甘かったらしく、誤ったマクロコマンドを送ると暴走したそうです（笑）。

グラフィックに関して、記事中に「資料によると、漢字などのフォントは拡大縮小回転しても綺麗に表示された、という記述がありますから、フォントデータはベクタデータとして持っていたように思えます。」とありますが、DDAボードが描画を担当していたということなので、ベクタデータで確定して良いのではないかと思います。
DDAはS/WかH/Wかの区別なく、BASICコマンドのLINEとかCIRCLEのアルゴリズムそのものですし。
となると、グラフィックボードのZ8001は何をしてたのかと言う疑問が沸くのですが（笑）

PC-6001どころかif-800よりも更に前からMZではMML記述ができたということですね。
p6erとしてはグヌヌがグヌヌヌになったくらいの気分ですがｗ、日本のマイコン史としては80年代ところか70年代からMMLが使えるマシンがあったという事実は大きいなーと思います。

とても貴重なコメントをありがとうございます。

MZ-80シリーズの場合、所謂MMLと言われるような演奏用文字譜を
解釈して実際に音に出すのは、BASIC本体ではなくモニタ、今で言う
BIOS相当のプログラムの担当です。BASICは演奏データのポインタを
モニタに渡すぐらいしかしてません。

またMUSIC命令は最初期のバージョンであるSP-5001からサポート
しています。というかモニタに機能があるのにBASICでサポートしない
理由はありませんわな。

というわけで、MZ-80におけるMMLは1978年12月には世に出て
いた、ということになりますね。

ケーブルを変えてみたり、おっしゃる通り800×600で接続した後に
繋ぎ直してみたりしましたがVが480で認識されてしまう状況は変わらずです・・

もうちょっと悩んでみて、もう一台買ってみようと思います。
本当にありがとうございました。

X68000 SUPERを接続してOSD情報を表示した画面を記事に追加してみました。[追記2]
Human68Kの画面は縦方向の解像度が512ドットなので、FormatのVが480だと画面に収まらずにはみ出てしまいますね。私のLCD-8000VではFormatのVは600なので画面内に収まっているのだと思います。
X68000に接続した直後ではたまに表示位置がずれる事はありますが、画面から大きくはみでるということはありませんでした。

VERSIONは090626でした。これが日付だとすると2009年6月26日ということになるのでしょうか。でも、購入した時期は2013年6月です。

例えば、画面の解像度を800×600にしたWindows PCを接続してみてLCD-8000Vを解像度を800×600として認識させた後にX68000をつなぎなしてみるとかどうでしょうか。

LCD-8000VとX68000なのですが、私の環境ではどうしても
human画面で下のファンクションキー表示が切れてしまいます。
もしよろしければ、X68000のhuman画面を映した祭、
LCD-8000VのＯＳＤ「情報」項目の表示内容を教えていただけませんか？

参考までに、私のものでは
Source: VGA
Format: H 800 V480
VERSION: VGA ONLY 091014
となっております。

大変お手数ですが、よろしくお願いいたします。